ポスト処理ツール¶
この章ではPAMC計算のポスト処理ツールと解析の流れを解説します。
以下のツールが script ディレクトリに用意されています。 チュートリアルでは例を用いて解析の流れを紹介します。 個別のツールについての詳細は、リファレンスの各項目を参照してください。
- extract_combined.py
combined 形式で出力されたログファイルから特定の項目を取り出します。
- plt_1D_histogram.py
1次元周辺化ヒストグラムを作成します。
- plt_2D_histogram.py
2次元周辺化ヒストグラムを作成します。
- plt_model_evidence.py
model evidence を計算します。
- separateT.py
MCMCのログファイルを温度点ごとに分割します。
- summarize_each_T.py
MCMCが出力するログファイルからannealing後のレプリカの情報を取り出し、温度点ごとに集約します。